通常情况下 　　pH对液相色谱色谱分离的影响主要决定于待分离的组分对pH的敏感度，换句话说就是待分离的组分极性的大小，当待分离的组分极性较大，比如有机弱酸或有机弱碱等，pH不同会影响有机酸碱的存在型体，当大量离子型组分存在时，会改变待分离组分的分配系数，从而改变分离度。 　　极端情况下 pH过高或过低会导致硅胶表面性质，所以现在的液相色谱柱有使用的pH范围，当pH不合适的情况下，会导致色谱柱的损坏，进而导致分离情况发生变化。 　　所以如果pH不超过色谱柱的容忍范围，pH的影响主要决定于待分离组分的极性大小。