气相色谱仪检测器不同，需要的载气也不同，所分析的样品不一样，载气也会不同。例如FID（氢火焰检测器）一般使用N2或者氦气作为载气，氢气为燃气，空气为助燃气。而TCD（热导检测器）可使用氢气，氮气，氦气作为载气。
气相色谱开机前要先打开载气、氦气、空气总阀的开关，检查二次表的压力一般都在0.6MPa(氦气在0.2MPa)。仪器电源开启后要先通过自检再打开工作站， 确认每根柱子都要有流量之后再升温做样。
使用前一项十分重要的工作是气密性检查，如果气路泄露，会导致仪器工作不稳定或灵敏度下降甚至可能发生爆炸，因此在操作使用前必须进行这项工作，即检查载气流路，如果氢气和空气流路若未拆动过，可不检查。
检测器
FID和TCD的检测，温度要控制在室温10℃到339℃，控温温度在±0.1℃。FID的检测限Mt小于等于1×10 -11 g/s，噪声小于等于5×10-14A，漂移小于等于5×10 -13A/30min。TCD的灵敏度S大于等于3000mV·mL/mg，噪声小于等于0.03mV，漂移小于等于0.1mV/30min。
注意事项
气相色谱仪在使用时温度不可超过进样口温度的上限，以免破坏进样口；要做好进样口污染的常规处理：隔垫和去活玻璃毛的更换、清洗或更换衬管、跟换密封垫、分流平板的清洗；操作时要保证有干净的载气和干净的进样口时才可以接柱子。
常见的是污染问题，做高沸点物质后应将柱子老化，把温度升高后赶出残留物，以防止长期的积累，造成柱子的永远损坏。
