凝胶色谱柱的应用也越来越广泛，使用过后也要对色谱柱进行保养，这样才能使它的使用寿命更长久，在遇到什么问题时需采取相应的措施。
凝胶色谱柱是以刚性的球型硅胶为基质，在其表面通过共价键化学键合亲水基团而成。凝胶色谱柱的填料具有高性能尺寸排阻色谱所必需的性能，即低吸附性和良好的孔径分布；其pH适用范围为2.5-7.5，可以使用与水完全互溶的有机溶剂，如乙腈、丙酮、甲醇或乙醇等。凝胶色谱柱适合用于分析分离蛋白质和多肽类样品。
凝胶色谱柱专为合成高分子的在高温下GPC分析而设计。尽管高度交联的PS/DVB 粒子广泛应用于合成高分子的分析，但是这种粒子会在有机溶剂中产生膨胀，尤其在高温下膨胀更为明显。凝胶色谱柱很好的解决了这个问题。填料以刚性硅胶为基质，经过独特的表面化学修饰，在高温和有机溶剂中可以保持极高的稳定性。此外相对于有机聚合物填料，HTP SEC填料的刚性结构减小了分离过程中的传质，从而取得更高的分辨率和分离效率。
凝胶色谱柱特点：
高柱容量、高分辨率
宽的pH范围 (pH范围2-8.5)
使用寿命长
低盐浓度洗脱，适合LC-MS分析
对于生物样品无强吸附
极低的非特异性吸附, 高的蛋白回收率及活性回收率
解决多维色谱分析应用
凝胶色谱柱的存放。如果色谱柱暂时不用，存放时要注意以下几点：
a.几天之内的短期放置，凝胶柱则用蒸馏水来冲洗，再把色谱柱的两头用密封螺丝密封好即可。
b.如果色谱柱长期不用，仅用上述方法来处理就不行了，这时应使用色谱柱使用说明书中所指明的溶剂来充满色谱柱，凝胶柱则不能用水了，因柱内如果有微生物的生长则会使柱效降低，此时应用0.05%的NaNs水溶液(防腐剂)来冲洗色谱柱，再将色谱柱封严。凝胶色谱柱长期放置时，一定要将色谱柱的两端封严，以防止由于溶剂挥发而造成的柱填料干缩现象，因这可导致柱效的严重降低。
c.色谱柱应贮存在室温下，如果放置于0℃以下的环境里，柱内就会结冰，这也将导致柱效的降低。
凝胶色谱柱是亲水、刚性、化学和机械性能很好的球性多孔高聚物。使用pH值范围是2-12，可以使用含有50%的混合有机溶剂为流动相。凝胶色谱柱因为有大的排阻极限和良好的校正曲线线性，所以适合分析多分散系如糖和人造水溶性聚合物。用于分离蛋白质、多肽、多糖、DNA、RNA、水溶性的有机聚合物和其他水溶性大分子样品等。
