为了确保移液器的准确度和度，应根据具体使用情况进行定期保养。特别是在使用腐蚀性溶剂后，应该对移液器进行清洁。通过这些简单的清洁和保养方法，可适当地延长移液器的使用寿命。
l、外部清洗
方法：根据使用情况，可以用洗洁精清洗，或用60％异丙醇消毒，然后用双蒸水淋洗，晾干。
2、内部清洗
一般密封圈无需维护，活塞清洗或更换后需要涂上薄薄一层硅酮油脂移液器每日用完后，应旋转到刻度，让弹簧恢复原形，有助于保持弹簧弹性。针对不同性质的液体，有不同的清洗和保养方法。
水溶液和缓冲液用蒸馏水校准移液器，结果非常准确打开移液器，用双蒸水冲洗污染的部分，可以在干燥箱中干燥，温度不超过60~C。给活塞涂抹少量润滑油润滑油
无机酸／碱如果经常移取高浓度的酸／碱液，可以偶尔用双蒸水清洗移液器的下半支。使用带有滤芯的吸嘴移液器中使用的塑料材料和陶质活塞大都是耐酸耐碱材料(除了氢氟酸)。但酸／碱液的蒸气可能会进入移液器的下部，影响其性能，清洁方法同“水溶液”部分
具有潜在传染性的液体为了避免污染，应该使用带有滤芯的吸嘴。或者使用正向置换方法移取对污染的部分进行121~C、20min高压灭菌，或者将移液器下部浸入实验室常规的消毒剂中。随后用双蒸水清洗，并用上述方法进行干燥
细胞培养物为了保证无菌，应使用带有滤芯的吸嘴参照“具有潜在传染性的液体”的清洁方法
有机溶剂密度与水不同，不许调节移液器；由于蒸汽压高和湿润行为的变化，应快速移液；移液结束后，拆开移液器，让液体挥发通常对于蒸气压高的液体，任其自然挥发的过程就足够了，或者将下部浸人消毒剂中(确保浸人的液面不要超过密封圈弹簧位置，以避免受到液体腐蚀)。用双蒸水清洗，并用上述干燥方法将其干燥
放射性溶液为了避免污染，应该使用带有滤芯的吸嘴，或者使用正向置换方法拆开移液器，将污染部分浸入复合溶液或专用的清洁溶液，用双蒸水清洗，并用上述干燥方法将其干燥
核酸／蛋白质溶液为了避免污染，应该使用带有滤芯的吸嘴，或者使用正向置换方法蛋白质：拆开移液仪，用去污剂清洗，清洗和干燥方法如上所述核酸：在氨基乙酸／盐酸缓冲液(pH2．0)中煮沸10min(确保琼脂糖凝胶电泳检测不到DNA残留)，用双蒸水清洗干净，并用上述的干燥方法干燥，同时给活塞涂抹少量润滑油
3、消毒
包括紫外消毒、高压消毒。若移液器采用抗紫外线的高质量材料做成，可以采用紫外消毒。高压消毒分为整支移液器高压灭菌消毒和半支高压消毒。整支高压灭菌消毒前需旋松连接部位，进行部分拆卸和半支高压消毒；下半支可以拆卸，进行高压消毒(121℃、20min)，如有必要，将消毒部件在室温下晾干，等到温度彻底降低后再安装。
