手持ATP荧光检测仪用于检测食品及食品加工器具、医疗器械等致病菌微生物含量检测，判断表面洁净程度及卫生情况。
由于ATP是广泛存在于致病菌微生物细胞内的，ATP微生物进行新陈代谢的重要能量物质;
被测样品中所含的致病菌微生物含量与所含的ATP之间存在一定的函数关系;
而手持ATP荧光检测仪利用ATP检测试剂与被测样品之间的反应，检测出发光值，从而判断本册样品中所含的致病菌微生物的含量。
手持ATP荧光检测仪与台式ATP荧光检测仪相比，流动性要强;
可以满足现场快速检测的需求，利用在餐饮服务、医疗系统等流动性场所进行现场检测。
手持ATP荧光检测仪采用一体化拭子形式完成现场快速检测。
手持ATP荧光检测仪检测微生物含量的过程中取样环节十分重要，取样可以分为两种形式;
一种是面积类样品取样，将ATP拭子采样棒一支在物体表面或双手指曲面从指跟到指端来回涂擦个两次，并随之转动采样拭子。
另一种是体积类样品取样，将ATP拭子采样棒一支在待测液体充分浸湿。
取样完成后将拭子放入手持ATP荧光检测仪，获得被测样本与细菌污染程度相对应的ATP生物荧光值，得出菌落数指标。
根据检测数据结果判断被测样品的卫生情况。
